接种后将菌袋移入发菌室(棚）内堆放发菌，袋口两端向外，行与行之间留操作道。堆高根据栽培季节而定，春栽堆10～12层，秋栽只能堆5～8层，以利保持或调节堆内温度。为有利菌丝健壮生长，应根据不同发菌阶段进行管理。
　　1.发菌前期(接种后15天内）
　　接种后2～3天，菌种块就可萌发，并开始吃料，然后菌丝向四周辐射生长，占满料面，这段时间约需15天。此阶段菌丝处于恢复和萌发阶段，故料温一般比室温低l-2℃，空气温度宜掌握在27℃左右，使袋内料温处于菌丝生长的最佳温度。如果冬天或早春气温低，可用草苫或保温被加盖菌袋，使堆温提高，以满足菌丝生长需求。
　　2.发菌中期（15～40天）
　　菌袋中的菌丝封口后，继续向培养料内深人，当菌丝生长达到菌袋长度的一半时，由于菌丝生长旺盛，呼吸加强，代谢活跃，自身产生热量，应解开袋口补充氧气，排除二氧化碳。料温比室温高4～5℃，此时如管理跟不上，易出现烧菌或缺氧窒息现象。如缺氧，菌丝长得纤细，不浓白，色淡，培养料显露。因此，必须加强通风换气和降温管理。
　　3.发菌后期(40-60天）
　　当菌丝生长超过一半时，解袋松口，菌丝旺盛生长，浓密洁白，菌丝量急剧增大，呼吸强度旺盛，对培养料的分解和转化活性增强，菌丝体内营养积累增多。此阶段温度宜在23～24℃，特别注意防止高温。如室温达27℃，料温就会超过30尤，容易导致菌丝受到严重损伤，甚至发生“烧菌”，菌袋变软，培养料酸臭。因此，必须注意疏袋散热，以控制堆温，降低料温。
　　菌袋在适温20～27℃下经50～60天培养接近成熟，应适时翻卷袋口，转色催菇。翻卷袋口后氧气充足，升温非常快，往往堆温上升5～81，要及时通风降温，排除二氧化碳，否则菌丝变黄退化，菌袋内培养料急剧失水收缩，对后期菌丝生长及菌皮形成、转色和原基形成产生不良影响。